Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX0

ZNF728, Zinc finger protein 728, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF728P0DKX0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF728P0DKX0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF728P0DKX0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms