Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM200BP0CF97 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM200BP0CF97 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms