Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M4

RHOXF2B, Rhox homeobox family member 2B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2BP0C7M4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOXF2BP0C7M4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms