Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP1P09874 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP1P09874 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP1P09874 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP1P09874 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP1P09874 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP1P09874 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP1P09874 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP1P09874 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP1P09874 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP1P09874 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP1P09874 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PARP1P09874 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP1P09874 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP1P09874 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP1P09874 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP1P09874 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP1P09874 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP1P09874 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARP1P09874 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP1P09874 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP1P09874 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP1P09874 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP1P09874 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP1P09874 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP1P09874 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARP1P09874 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP1P09874 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP1P09874 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP1P09874 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP1P09874 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP1P09874 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP1P09874 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP1P09874 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP1P09874 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP1P09874 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARP1P09874 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP1P09874 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP1P09874 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP1P09874 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP1P09874 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP1P09874 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP1P09874 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP1P09874 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP1P09874 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP1P09874 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP1P09874 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP1P09874 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP1P09874 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP1P09874 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP1P09874 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP1P09874 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP1P09874 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP1P09874 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP1P09874 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP1P09874 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP1P09874 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP1P09874 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP1P09874 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP1P09874 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP1P09874 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP1P09874 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP1P09874 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP1P09874 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP1P09874 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP1P09874 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP1P09874 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP1P09874 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP1P09874 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP1P09874 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP1P09874 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP1P09874 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP1P09874 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP1P09874 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP1P09874 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP1P09874 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP1P09874 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP1P09874 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP1P09874 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP1P09874 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP1P09874 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP1P09874 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP1P09874 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP1P09874 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP1P09874 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP1P09874 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP1P09874 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP1P09874 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP1P09874 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP1P09874 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP1P09874 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP1P09874 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP1P09874 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP1P09874 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP1P09874 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP1P09874 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP1P09874 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP1P09874 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP1P09874 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP1P09874 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms