Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACAA1P09110 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms