Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP3P08254 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP3P08254 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP3P08254 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP3P08254 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP3P08254 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP3P08254 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP3P08254 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP3P08254 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP3P08254 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP3P08254 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP3P08254 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP3P08254 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP3P08254 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP3P08254 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP3P08254 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP3P08254 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP3P08254 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP3P08254 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP3P08254 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP3P08254 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP3P08254 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP3P08254 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP3P08254 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP3P08254 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP3P08254 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP3P08254 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP3P08254 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP3P08254 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP3P08254 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP3P08254 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP3P08254 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP3P08254 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP3P08254 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP3P08254 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP3P08254 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP3P08254 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP3P08254 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP3P08254 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP3P08254 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP3P08254 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP3P08254 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP3P08254 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP3P08254 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP3P08254 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP3P08254 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP3P08254 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP3P08254 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP3P08254 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP3P08254 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP3P08254 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP3P08254 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP3P08254 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP3P08254 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP3P08254 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP3P08254 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP3P08254 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP3P08254 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP3P08254 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP3P08254 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP3P08254 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP3P08254 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP3P08254 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP3P08254 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP3P08254 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP3P08254 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP3P08254 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP3P08254 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP3P08254 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP3P08254 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP3P08254 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP3P08254 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP3P08254 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP3P08254 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP3P08254 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP3P08254 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP3P08254 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP3P08254 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP3P08254 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP3P08254 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP3P08254 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP3P08254 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP3P08254 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP3P08254 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP3P08254 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP3P08254 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP3P08254 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP3P08254 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP3P08254 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP3P08254 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP3P08254 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP3P08254 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP3P08254 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP3P08254 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP3P08254 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP3P08254 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP3P08254 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP3P08254 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP3P08254 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP3P08254 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms