Protein–RNA interactions for Protein: P02675

FGB, Fibrinogen beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGBP02675 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGBP02675 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FGBP02675 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGBP02675 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGBP02675 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGBP02675 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGBP02675 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGBP02675 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGBP02675 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FGBP02675 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGBP02675 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGBP02675 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGBP02675 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGBP02675 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGBP02675 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGBP02675 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGBP02675 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGBP02675 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGBP02675 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGBP02675 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGBP02675 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGBP02675 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGBP02675 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FGBP02675 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGBP02675 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGBP02675 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGBP02675 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGBP02675 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGBP02675 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGBP02675 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FGBP02675 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGBP02675 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGBP02675 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGBP02675 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGBP02675 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGBP02675 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGBP02675 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGBP02675 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGBP02675 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGBP02675 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FGBP02675 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGBP02675 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGBP02675 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGBP02675 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGBP02675 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGBP02675 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGBP02675 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGBP02675 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGBP02675 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FGBP02675 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGBP02675 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGBP02675 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGBP02675 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGBP02675 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGBP02675 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGBP02675 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGBP02675 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGBP02675 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGBP02675 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGBP02675 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGBP02675 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FGBP02675 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGBP02675 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGBP02675 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGBP02675 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGBP02675 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGBP02675 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGBP02675 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGBP02675 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGBP02675 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGBP02675 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGBP02675 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGBP02675 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGBP02675 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGBP02675 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGBP02675 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGBP02675 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGBP02675 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGBP02675 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGBP02675 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGBP02675 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGBP02675 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FGBP02675 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGBP02675 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGBP02675 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGBP02675 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGBP02675 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGBP02675 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGBP02675 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGBP02675 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FGBP02675 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGBP02675 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGBP02675 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FGBP02675 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGBP02675 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGBP02675 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGBP02675 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGBP02675 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGBP02675 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGBP02675 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms