Protein–RNA interactions for Protein: P01034

CST3, Cystatin-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST3P01034 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CST3P01034 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CST3P01034 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CST3P01034 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CST3P01034 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CST3P01034 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CST3P01034 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CST3P01034 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CST3P01034 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CST3P01034 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CST3P01034 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CST3P01034 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CST3P01034 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CST3P01034 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CST3P01034 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CST3P01034 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CST3P01034 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CST3P01034 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CST3P01034 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CST3P01034 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CST3P01034 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CST3P01034 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CST3P01034 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CST3P01034 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CST3P01034 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CST3P01034 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CST3P01034 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CST3P01034 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CST3P01034 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CST3P01034 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CST3P01034 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CST3P01034 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CST3P01034 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CST3P01034 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CST3P01034 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CST3P01034 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CST3P01034 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CST3P01034 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CST3P01034 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CST3P01034 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CST3P01034 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CST3P01034 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CST3P01034 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CST3P01034 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CST3P01034 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CST3P01034 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CST3P01034 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CST3P01034 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CST3P01034 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CST3P01034 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CST3P01034 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CST3P01034 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CST3P01034 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CST3P01034 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CST3P01034 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CST3P01034 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CST3P01034 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CST3P01034 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CST3P01034 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CST3P01034 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CST3P01034 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CST3P01034 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CST3P01034 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CST3P01034 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CST3P01034 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST3P01034 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST3P01034 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST3P01034 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST3P01034 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST3P01034 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST3P01034 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST3P01034 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST3P01034 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST3P01034 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST3P01034 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST3P01034 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CST3P01034 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST3P01034 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST3P01034 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST3P01034 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CST3P01034 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CST3P01034 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CST3P01034 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CST3P01034 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CST3P01034 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CST3P01034 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CST3P01034 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CST3P01034 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CST3P01034 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CST3P01034 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CST3P01034 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CST3P01034 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CST3P01034 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CST3P01034 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CST3P01034 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CST3P01034 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CST3P01034 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CST3P01034 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CST3P01034 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CST3P01034 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms