Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCC1O94876 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCC1O94876 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCC1O94876 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCC1O94876 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCC1O94876 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCC1O94876 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCC1O94876 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCC1O94876 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCC1O94876 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCC1O94876 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCC1O94876 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCC1O94876 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCC1O94876 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCC1O94876 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCC1O94876 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCC1O94876 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCC1O94876 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCC1O94876 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCC1O94876 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCC1O94876 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMCC1O94876 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCC1O94876 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms