Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSDE1O75534 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms