Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 C17orf49-205ENST00000547747 430 ntTSL 317.08■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SCRN2-211ENST00000583090 683 ntTSL 317.03■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MIEF1-204ENST00000428069 1379 ntTSL 217.01■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 DECR2-209ENST00000461947 1017 ntTSL 517■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 UEVLD-206ENST00000490736 556 ntTSL 517■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CYFIP2-224ENST00000622696 1294 ntTSL 216.99■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FAM58A-201ENST00000429336 593 ntTSL 516.99■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 NME1-206ENST00000475573 781 ntTSL 316.99■□□□□ 0.315e-8■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ACAD10-211ENST00000508303 2334 ntTSL 216.99■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 HARS2-212ENST00000520095 564 ntTSL 416.98■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TCEA2-206ENST00000440819 1083 ntTSL 516.96■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-209ENST00000461892 871 ntTSL 216.92■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MIEF1-206ENST00000434364 744 ntTSL 516.92■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LGMN-212ENST00000556097 1054 ntTSL 516.91■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LGMN-218ENST00000557694 949 ntTSL 216.91■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 BCAP31-203ENST00000423827 669 ntTSL 516.88■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GYG2-207ENST00000469234 566 ntTSL 316.84■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TAF1C-208ENST00000563428 2531 ntTSL 216.83■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 POLG-203ENST00000526314 700 ntTSL 316.82■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ATP9B-219ENST00000589951 585 ntTSL 416.82■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 HARS2-208ENST00000510104 1450 ntTSL 1 (best)16.82■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TRMT44-208ENST00000532477 1851 ntTSL 216.81■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TTC4-202ENST00000371284 2124 ntTSL 516.77■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ARFGAP2-220ENST00000529455 840 ntTSL 516.76■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 G6PD-204ENST00000433845 817 ntTSL 316.76■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CSMD1-207ENST00000520451 532 ntTSL 216.75■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 DOCK10-205ENST00000458608 528 ntTSL 416.71■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 DOK4-216ENST00000569250 586 ntTSL 416.69■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 STX1A-213ENST00000496216 714 ntTSL 516.66■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 UEVLD-211ENST00000540917 551 ntTSL 416.64■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 REXO1-206ENST00000588743 369 ntTSL 316.63■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PECR-207ENST00000487318 742 ntTSL 516.61■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ASGR2-205ENST00000574868 1202 ntTSL 516.59■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 HARS2-207ENST00000509299 648 ntTSL 316.58■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PDHX-207ENST00000533262 561 ntTSL 416.58■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-245ENST00000639820 2837 ntTSL 516.57■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 GPS1-219ENST00000583641 795 ntTSL 216.57■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 HDAC7-216ENST00000450805 579 ntTSL 416.57■□□□□ 0.242e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SIDT2-218ENST00000532960 540 ntTSL 416.56■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 WDR18-205ENST00000590354 678 ntTSL 216.53■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RNF138-207ENST00000580519 575 ntTSL 416.52■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ABCF3-208ENST00000471226 650 ntTSL 516.5■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FN3KRP-208ENST00000576363 666 ntTSL 1 (best)16.49■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 C17orf49-204ENST00000547709 626 ntTSL 316.48■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 AREL1-210ENST00000555249 581 ntTSL 316.45■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MFN2-204ENST00000484391 294 ntTSL 316.44■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PECR-208ENST00000497889 824 ntTSL 516.41■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 DOCK10-204ENST00000435582 592 ntTSL 316.39■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 BATF2-205ENST00000534177 569 ntTSL 416.39■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TNRC6C-208ENST00000591851 1642 ntTSL 216.37■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ZNF671-206ENST00000601584 1932 ntTSL 216.36■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TMPRSS4-203ENST00000517544 789 ntTSL 316.35■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TMEM14B-206ENST00000463448 1589 ntTSL 1 (best)16.34■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MPPE1-225ENST00000592331 602 ntTSL 416.33■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 DHX30-214ENST00000492893 601 ntTSL 216.33■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TAF1C-204ENST00000544090 2747 ntTSL 216.28■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 NRF1-207ENST00000477428 513 ntTSL 316.24■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 JADE2-209ENST00000512386 567 ntTSL 416.22■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 KRI1-206ENST00000537363 2255 ntTSL 516.13■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TRIP10-207ENST00000596673 586 ntTSL 316.13■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TMEM14B-209ENST00000473166 752 ntTSL 316.12■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 172.3
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 2699.2 ms