Protein–RNA interactions for Protein: O60813

PRAMEF11, PRAME family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF11O60813 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF11O60813 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF11O60813 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF11O60813 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF11O60813 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF11O60813 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF11O60813 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF11O60813 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF11O60813 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF11O60813 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF11O60813 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF11O60813 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF11O60813 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF11O60813 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF11O60813 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF11O60813 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF11O60813 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF11O60813 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF11O60813 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF11O60813 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF11O60813 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF11O60813 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms