Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms