Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COCHO43405 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COCHO43405 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COCHO43405 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COCHO43405 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COCHO43405 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COCHO43405 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COCHO43405 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COCHO43405 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COCHO43405 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COCHO43405 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COCHO43405 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COCHO43405 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COCHO43405 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COCHO43405 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COCHO43405 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COCHO43405 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COCHO43405 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COCHO43405 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COCHO43405 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COCHO43405 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COCHO43405 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COCHO43405 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COCHO43405 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COCHO43405 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COCHO43405 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COCHO43405 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COCHO43405 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COCHO43405 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COCHO43405 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COCHO43405 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COCHO43405 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COCHO43405 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COCHO43405 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COCHO43405 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COCHO43405 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COCHO43405 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COCHO43405 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COCHO43405 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COCHO43405 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COCHO43405 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COCHO43405 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COCHO43405 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COCHO43405 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COCHO43405 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COCHO43405 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COCHO43405 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COCHO43405 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COCHO43405 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COCHO43405 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COCHO43405 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COCHO43405 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COCHO43405 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COCHO43405 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COCHO43405 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COCHO43405 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COCHO43405 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COCHO43405 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COCHO43405 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COCHO43405 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COCHO43405 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COCHO43405 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COCHO43405 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COCHO43405 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COCHO43405 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COCHO43405 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COCHO43405 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COCHO43405 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COCHO43405 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COCHO43405 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COCHO43405 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COCHO43405 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COCHO43405 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COCHO43405 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COCHO43405 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COCHO43405 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COCHO43405 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COCHO43405 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COCHO43405 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COCHO43405 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COCHO43405 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COCHO43405 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COCHO43405 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COCHO43405 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COCHO43405 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COCHO43405 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COCHO43405 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COCHO43405 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COCHO43405 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COCHO43405 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COCHO43405 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COCHO43405 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COCHO43405 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COCHO43405 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COCHO43405 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COCHO43405 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COCHO43405 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COCHO43405 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COCHO43405 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COCHO43405 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms