Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN3O15551 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN3O15551 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms