Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
FANCAO15360 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FANCAO15360 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FANCAO15360 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
FANCAO15360 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FANCAO15360 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FANCAO15360 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FANCAO15360 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FANCAO15360 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FANCAO15360 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FANCAO15360 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FANCAO15360 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FANCAO15360 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FANCAO15360 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FANCAO15360 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FANCAO15360 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FANCAO15360 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FANCAO15360 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FANCAO15360 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FANCAO15360 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FANCAO15360 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FANCAO15360 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FANCAO15360 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FANCAO15360 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FANCAO15360 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FANCAO15360 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FANCAO15360 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FANCAO15360 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FANCAO15360 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
FANCAO15360 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
FANCAO15360 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FANCAO15360 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FANCAO15360 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FANCAO15360 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
FANCAO15360 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
FANCAO15360 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FANCAO15360 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FANCAO15360 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FANCAO15360 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FANCAO15360 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
FANCAO15360 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
FANCAO15360 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
FANCAO15360 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
FANCAO15360 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FANCAO15360 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FANCAO15360 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FANCAO15360 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FANCAO15360 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FANCAO15360 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FANCAO15360 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FANCAO15360 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FANCAO15360 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FANCAO15360 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FANCAO15360 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FANCAO15360 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FANCAO15360 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FANCAO15360 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FANCAO15360 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FANCAO15360 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
FANCAO15360 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FANCAO15360 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FANCAO15360 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FANCAO15360 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FANCAO15360 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FANCAO15360 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FANCAO15360 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FANCAO15360 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FANCAO15360 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FANCAO15360 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FANCAO15360 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
FANCAO15360 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
FANCAO15360 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
FANCAO15360 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FANCAO15360 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
FANCAO15360 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
FANCAO15360 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FANCAO15360 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
FANCAO15360 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
FANCAO15360 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
FANCAO15360 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
FANCAO15360 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FANCAO15360 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FANCAO15360 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
FANCAO15360 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
FANCAO15360 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FANCAO15360 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FANCAO15360 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FANCAO15360 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FANCAO15360 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
FANCAO15360 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FANCAO15360 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FANCAO15360 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FANCAO15360 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FANCAO15360 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
FANCAO15360 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
FANCAO15360 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
FANCAO15360 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
FANCAO15360 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
FANCAO15360 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
FANCAO15360 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms