Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN3O15232 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN3O15232 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN3O15232 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN3O15232 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN3O15232 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN3O15232 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN3O15232 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN3O15232 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN3O15232 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN3O15232 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN3O15232 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN3O15232 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN3O15232 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN3O15232 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN3O15232 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN3O15232 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN3O15232 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN3O15232 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN3O15232 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN3O15232 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN3O15232 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN3O15232 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN3O15232 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN3O15232 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN3O15232 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN3O15232 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN3O15232 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN3O15232 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN3O15232 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN3O15232 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN3O15232 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN3O15232 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN3O15232 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN3O15232 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN3O15232 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN3O15232 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN3O15232 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN3O15232 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN3O15232 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN3O15232 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN3O15232 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN3O15232 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN3O15232 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN3O15232 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN3O15232 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN3O15232 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN3O15232 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN3O15232 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN3O15232 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN3O15232 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MATN3O15232 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MATN3O15232 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MATN3O15232 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MATN3O15232 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN3O15232 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN3O15232 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN3O15232 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN3O15232 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN3O15232 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN3O15232 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN3O15232 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN3O15232 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN3O15232 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN3O15232 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN3O15232 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN3O15232 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN3O15232 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN3O15232 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN3O15232 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN3O15232 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN3O15232 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN3O15232 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN3O15232 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN3O15232 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN3O15232 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN3O15232 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN3O15232 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN3O15232 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN3O15232 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms