Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GNPATO15228 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GNPATO15228 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GNPATO15228 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GNPATO15228 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GNPATO15228 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GNPATO15228 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNPATO15228 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNPATO15228 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNPATO15228 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNPATO15228 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNPATO15228 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNPATO15228 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNPATO15228 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNPATO15228 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNPATO15228 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNPATO15228 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNPATO15228 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNPATO15228 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNPATO15228 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNPATO15228 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNPATO15228 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNPATO15228 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNPATO15228 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNPATO15228 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNPATO15228 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNPATO15228 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPATO15228 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPATO15228 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPATO15228 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPATO15228 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPATO15228 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPATO15228 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPATO15228 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPATO15228 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPATO15228 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPATO15228 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPATO15228 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPATO15228 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPATO15228 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPATO15228 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPATO15228 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPATO15228 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPATO15228 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPATO15228 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNPATO15228 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNPATO15228 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNPATO15228 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNPATO15228 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNPATO15228 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNPATO15228 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNPATO15228 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNPATO15228 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNPATO15228 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNPATO15228 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GNPATO15228 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GNPATO15228 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GNPATO15228 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GNPATO15228 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GNPATO15228 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GNPATO15228 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GNPATO15228 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GNPATO15228 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
GNPATO15228 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GNPATO15228 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GNPATO15228 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GNPATO15228 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GNPATO15228 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GNPATO15228 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GNPATO15228 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GNPATO15228 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GNPATO15228 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GNPATO15228 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GNPATO15228 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GNPATO15228 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GNPATO15228 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GNPATO15228 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GNPATO15228 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GNPATO15228 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GNPATO15228 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GNPATO15228 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GNPATO15228 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GNPATO15228 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GNPATO15228 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GNPATO15228 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GNPATO15228 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GNPATO15228 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GNPATO15228 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GNPATO15228 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GNPATO15228 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GNPATO15228 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GNPATO15228 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GNPATO15228 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GNPATO15228 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GNPATO15228 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GNPATO15228 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GNPATO15228 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GNPATO15228 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GNPATO15228 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GNPATO15228 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms