Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F3O00716 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F3O00716 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F3O00716 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F3O00716 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F3O00716 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F3O00716 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F3O00716 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F3O00716 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F3O00716 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F3O00716 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F3O00716 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F3O00716 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F3O00716 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F3O00716 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F3O00716 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F3O00716 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F3O00716 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F3O00716 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F3O00716 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F3O00716 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F3O00716 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F3O00716 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F3O00716 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F3O00716 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F3O00716 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F3O00716 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F3O00716 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F3O00716 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F3O00716 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F3O00716 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F3O00716 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F3O00716 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F3O00716 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F3O00716 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F3O00716 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F3O00716 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F3O00716 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F3O00716 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F3O00716 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F3O00716 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F3O00716 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F3O00716 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F3O00716 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F3O00716 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F3O00716 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F3O00716 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F3O00716 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F3O00716 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F3O00716 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F3O00716 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F3O00716 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F3O00716 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F3O00716 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
E2F3O00716 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F3O00716 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F3O00716 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F3O00716 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F3O00716 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F3O00716 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F3O00716 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F3O00716 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F3O00716 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F3O00716 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F3O00716 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F3O00716 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F3O00716 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F3O00716 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F3O00716 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F3O00716 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F3O00716 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F3O00716 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F3O00716 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F3O00716 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F3O00716 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F3O00716 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F3O00716 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F3O00716 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F3O00716 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F3O00716 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F3O00716 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F3O00716 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F3O00716 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F3O00716 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F3O00716 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F3O00716 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F3O00716 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F3O00716 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F3O00716 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F3O00716 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F3O00716 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F3O00716 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F3O00716 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F3O00716 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F3O00716 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F3O00716 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F3O00716 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F3O00716 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F3O00716 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F3O00716 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms