Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGRNO00468 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGRNO00468 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGRNO00468 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGRNO00468 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGRNO00468 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGRNO00468 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AGRNO00468 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGRNO00468 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGRNO00468 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGRNO00468 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGRNO00468 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGRNO00468 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGRNO00468 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGRNO00468 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGRNO00468 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGRNO00468 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGRNO00468 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGRNO00468 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGRNO00468 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGRNO00468 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGRNO00468 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AGRNO00468 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGRNO00468 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGRNO00468 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGRNO00468 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGRNO00468 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGRNO00468 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGRNO00468 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGRNO00468 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGRNO00468 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGRNO00468 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGRNO00468 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGRNO00468 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AGRNO00468 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGRNO00468 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGRNO00468 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGRNO00468 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGRNO00468 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGRNO00468 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGRNO00468 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGRNO00468 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGRNO00468 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGRNO00468 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AGRNO00468 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AGRNO00468 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGRNO00468 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGRNO00468 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGRNO00468 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGRNO00468 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AGRNO00468 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGRNO00468 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGRNO00468 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGRNO00468 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGRNO00468 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGRNO00468 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGRNO00468 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGRNO00468 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGRNO00468 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGRNO00468 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGRNO00468 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AGRNO00468 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AGRNO00468 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGRNO00468 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AGRNO00468 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGRNO00468 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGRNO00468 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGRNO00468 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGRNO00468 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGRNO00468 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGRNO00468 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGRNO00468 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AGRNO00468 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGRNO00468 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGRNO00468 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms