Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QR89 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QR89 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QR89 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QR89 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QR89 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QR89 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QR89 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QR89 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QR89 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QR89 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QR89 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QR89 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QR89 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QR89 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QR89 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
J3QR89 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QR89 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QR89 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QR89 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QR89 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QR89 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QR89 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QR89 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QR89 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QR89 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QR89 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QR89 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QR89 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QR89 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QR89 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QR89 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QR89 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QR89 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QR89 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QR89 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
J3QR89 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3QR89 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3QR89 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
J3QR89 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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J3QR89 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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J3QR89 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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J3QR89 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
J3QR89 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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J3QR89 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3QR89 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3QR89 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3QR89 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3QR89 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3QR89 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3QR89 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3QR89 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
J3QR89 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QR89 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QR89 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QR89 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QR89 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QR89 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QR89 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QR89 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QR89 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QR89 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QR89 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QR89 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QR89 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QR89 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
J3QR89 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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