Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3KR12 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3KR12 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3KR12 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3KR12 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3KR12 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3KR12 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3KR12 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3KR12 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3KR12 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
J3KR12 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3KR12 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
J3KR12 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
J3KR12 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3KR12 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3KR12 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3KR12 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3KR12 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3KR12 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3KR12 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3KR12 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3KR12 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3KR12 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3KR12 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3KR12 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3KR12 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
J3KR12 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3KR12 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
J3KR12 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3KR12 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3KR12 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
J3KR12 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
J3KR12 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3KR12 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3KR12 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3KR12 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3KR12 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3KR12 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3KR12 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3KR12 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3KR12 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3KR12 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3KR12 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3KR12 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3KR12 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3KR12 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3KR12 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3KR12 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3KR12 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3KR12 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3KR12 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
J3KR12 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3KR12 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3KR12 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3KR12 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3KR12 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3KR12 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3KR12 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3KR12 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3KR12 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3KR12 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3KR12 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3KR12 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3KR12 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3KR12 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3KR12 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3KR12 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3KR12 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3KR12 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3KR12 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3KR12 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3KR12 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3KR12 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3KR12 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3KR12 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3KR12 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3KR12 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3KR12 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
J3KR12 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3KR12 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3KR12 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3KR12 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3KR12 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3KR12 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3KR12 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
J3KR12 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
J3KR12 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3KR12 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
J3KR12 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3KR12 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3KR12 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3KR12 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3KR12 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3KR12 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3KR12 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3KR12 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
J3KR12 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3KR12 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3KR12 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3KR12 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms