Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L12C9JPN9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L12C9JPN9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L12C9JPN9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L12C9JPN9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L12C9JPN9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L12C9JPN9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L12C9JPN9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L12C9JPN9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L12C9JPN9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L12C9JPN9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L12C9JPN9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L12C9JPN9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L12C9JPN9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L12C9JPN9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L12C9JPN9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L12C9JPN9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L12C9JPN9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L12C9JPN9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L12C9JPN9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L12C9JPN9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
USP17L12C9JPN9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L12C9JPN9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L12C9JPN9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L12C9JPN9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L12C9JPN9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L12C9JPN9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L12C9JPN9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L12C9JPN9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L12C9JPN9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L12C9JPN9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L12C9JPN9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L12C9JPN9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L12C9JPN9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L12C9JPN9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L12C9JPN9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms