Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PATL2C9JE40 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PATL2C9JE40 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms