Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HNRNPCL3B7ZW38 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNRNPCL3B7ZW38 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms