Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVV-2B6SEH9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ERVV-2B6SEH9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVV-2B6SEH9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms