Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD1B0YJ81 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms