Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C4orf47A7E2U8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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C4orf47A7E2U8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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C4orf47A7E2U8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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C4orf47A7E2U8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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C4orf47A7E2U8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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C4orf47A7E2U8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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C4orf47A7E2U8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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C4orf47A7E2U8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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C4orf47A7E2U8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C4orf47A7E2U8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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