Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM200CA6NKL6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms