Protein–RNA interactions for Protein: A6NGA9

TMEM202, Transmembrane protein 202, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM202A6NGA9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM202A6NGA9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM202A6NGA9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM202A6NGA9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM202A6NGA9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms