Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HELTA6NFD8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms