Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XIRP2A4UGR9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
XIRP2A4UGR9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XIRP2A4UGR9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms