Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LAMB4A4D0S4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMB4A4D0S4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms