Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCRBV7S3A2A0A539 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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TCRBV7S3A2A0A539 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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TCRBV7S3A2A0A539 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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TCRBV7S3A2A0A539 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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