Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0J9YYE9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms