Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
A0A087X1B8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A087X1B8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms