Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 DCAF5-202ENST00000389997 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TTYH2-202ENST00000441391 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 RSPH10B2-201ENST00000297186 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 RSPH10B-201ENST00000337579 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC079612.1-201ENST00000358775 3700 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 OLFML3-201ENST00000320334 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CACNB4-204ENST00000427385 1776 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 FAM86C2P-205ENST00000531806 1814 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 FKBP9P1-201ENST00000441699 1491 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 LASP1-203ENST00000433206 4023 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 C8orf17-202ENST00000625034 2775 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 IL1RN-204ENST00000409052 1903 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AL772363.1-201ENST00000371390 3222 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC068790.9-201ENST00000621669 2838 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PDSS2-202ENST00000369037 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ANGPTL7-201ENST00000376819 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ARMCX3-201ENST00000341189 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CAGE1-206ENST00000502583 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 FCRL3-201ENST00000368184 4725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 YWHAZ-207ENST00000395958 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PLEKHA5-203ENST00000429027 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 STYX-201ENST00000354586 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 KIAA1191-212ENST00000614420 2631 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CYP1B1-204ENST00000494864 1479 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 HNRNPR-202ENST00000374612 2694 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 NT5E-203ENST00000369651 3918 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 RUBCNL-208ENST00000429979 3979 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 FGFR1OP2-202ENST00000327214 2790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AP3B2-203ENST00000535359 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ERBB2-204ENST00000541774 4341 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC011525.2-202ENST00000590611 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 LINC00664-202ENST00000596718 3029 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 IST1-201ENST00000329908 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MRPS25-201ENST00000253686 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SYNPO-204ENST00000519664 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MVK-202ENST00000392727 1770 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CSF3R-205ENST00000373106 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SLA-203ENST00000427060 1914 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PHF21B-212ENST00000629843 3491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 C10orf128-202ENST00000374151 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 DCUN1D3-202ENST00000563934 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 ATP1A3-208ENST00000545399 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CLCN6-206ENST00000376496 2922 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC010761.1-201ENST00000582718 899 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LSAMPQ13449 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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