Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TMEM136-201ENST00000314475 1434 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AC010148.1-203ENST00000413842 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 ABHD17B-201ENST00000333421 2614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 AC106748.1-201ENST00000454801 384 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 APTX-220ENST00000476858 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 LINC00868-203ENST00000592919 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 ZNF135-201ENST00000313434 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 HSH2D-206ENST00000613986 1957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 AL353626.2-201ENST00000615372 130 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 SIRPG-202ENST00000303415 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 SIRPG-204ENST00000381580 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AC018521.1-202ENST00000641877 2655 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 KIAA0319L-202ENST00000373266 2377 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 RPL35A-206ENST00000464167 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 HADH-210ENST00000626637 1774 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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