Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF1Q9Y548 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF1Q9Y548 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF1Q9Y548 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF1Q9Y548 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF1Q9Y548 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF1Q9Y548 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF1Q9Y548 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF1Q9Y548 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF1Q9Y548 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF1Q9Y548 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF1Q9Y548 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF1Q9Y548 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF1Q9Y548 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF1Q9Y548 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF1Q9Y548 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
YIPF1Q9Y548 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
YIPF1Q9Y548 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF1Q9Y548 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms