Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC42.47■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC42.38■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
DCAF1Q9Y4B6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.36■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC42.33■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.33■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC42.32■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
DCAF1Q9Y4B6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
DCAF1Q9Y4B6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms