Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFE2L3Q9Y4A8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2L3Q9Y4A8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
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