Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHTOPQ9Y3Y2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHTOPQ9Y3Y2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms