Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
R3HCC1Q9Y3T6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
R3HCC1Q9Y3T6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms