Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.4■■■■■ 5.82
NISCHQ9Y2I1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.4■■■■■ 5.82
NISCHQ9Y2I1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC51.4■■■■■ 5.82
NISCHQ9Y2I1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC51.4■■■■■ 5.82
NISCHQ9Y2I1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC51.4■■■■■ 5.82
NISCHQ9Y2I1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC51.4■■■■■ 5.82
NISCHQ9Y2I1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC51.4■■■■■ 5.82
NISCHQ9Y2I1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC51.4■■■■■ 5.82
NISCHQ9Y2I1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC51.39■■■■■ 5.82
NISCHQ9Y2I1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC51.39■■■■■ 5.82
NISCHQ9Y2I1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.39■■■■■ 5.82
NISCHQ9Y2I1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC51.39■■■■■ 5.82
NISCHQ9Y2I1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.82
NISCHQ9Y2I1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.82
NISCHQ9Y2I1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.38■■■■■ 5.82
NISCHQ9Y2I1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.82
NISCHQ9Y2I1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC51.37■■■■■ 5.81
NISCHQ9Y2I1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC51.37■■■■■ 5.81
NISCHQ9Y2I1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC51.36■■■■■ 5.81
NISCHQ9Y2I1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC51.36■■■■■ 5.81
NISCHQ9Y2I1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC51.36■■■■■ 5.81
NISCHQ9Y2I1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.36■■■■■ 5.81
NISCHQ9Y2I1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.36■■■■■ 5.81
NISCHQ9Y2I1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC51.36■■■■■ 5.81
NISCHQ9Y2I1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.35■■■■■ 5.81
NISCHQ9Y2I1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC51.35■■■■■ 5.81
NISCHQ9Y2I1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC51.34■■■■■ 5.81
NISCHQ9Y2I1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC51.33■■■■■ 5.81
NISCHQ9Y2I1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC51.33■■■■■ 5.81
NISCHQ9Y2I1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.33■■■■■ 5.81
NISCHQ9Y2I1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC51.33■■■■■ 5.81
NISCHQ9Y2I1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC51.33■■■■■ 5.81
NISCHQ9Y2I1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC51.32■■■■■ 5.81
NISCHQ9Y2I1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC51.32■■■■■ 5.81
NISCHQ9Y2I1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.32■■■■■ 5.81
NISCHQ9Y2I1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC51.31■■■■■ 5.81
NISCHQ9Y2I1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC51.31■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.31■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.31■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC51.3■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC51.29■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC51.29■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC51.28■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.28■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC51.28■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC51.28■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.28■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.28■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC51.28■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC51.28■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC51.28■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC51.28■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.27■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.27■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC51.27■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC51.27■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC51.27■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC51.27■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC51.27■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.26■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC51.26■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC51.26■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.8
NISCHQ9Y2I1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC51.25■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC51.25■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC51.25■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC51.24■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.24■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.24■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.24■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC51.23■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC51.23■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC51.23■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC51.23■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC51.23■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC51.23■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC51.22■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC51.22■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC51.22■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC51.22■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC51.21■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC51.21■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.21■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC51.2■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.2■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.79
NISCHQ9Y2I1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC51.18■■■■■ 5.78
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