Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GINS2Q9Y248 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GINS2Q9Y248 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GINS2Q9Y248 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms