Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM50BQ9Y247 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms