Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIGD1AQ9Y241 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms