Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML2Q9UQR0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms