Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNND2Q9UQB3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms