Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH4Q9UQ05 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH4Q9UQ05 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH4Q9UQ05 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH4Q9UQ05 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH4Q9UQ05 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH4Q9UQ05 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNH4Q9UQ05 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNH4Q9UQ05 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNH4Q9UQ05 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNH4Q9UQ05 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms